Epigenetic, Chromatin assembly/repair, Nuclear bodies, Centromeres, Herpes simplex virus 1, latency in neurons, transcriptional regulation. site web
Patrick LOMONTE, DR2 CNRS, HDR, patrick.lomonte at univ-lyon1.fr (+3347244379)
Armelle CORPET- MCU/UCBL
Pascale TEXIER, IE2 CNRS
Aleth CALLE IE1 INSERM
Indri ERLIANDRI (Post-doctorant LabEX/UCBL)
Mohamed Ali MAROUI (post-doc ANR-VIRUCEPTION)
Camille Cohen (Doctorante LabEX)
Institut NeuroMyoGène (INMG), _CNRS UMR 5310 - INSERM U1217 - Université Lyon 1
Université Claude Bernard Lyon 1,
16, rue Raphaël Dubois (bât. G. Mendel)
69622 Villeurbanne Cedex
Les thématiques développées dans l’équipe sont : (i) d’une part l’étude in vivo, dans un modèle murin, du rôle de l’organisation nucléaire impliquant les domaines PML et les centromères dans le contrôle transcriptionnel du génome de l’HSV-1 dans les neurones des ganglions trijumaux au cours du processus de latence/réactivation virale ; (ii) d’autre part nous nous intéressons aux modifications épigénétiques de la chromatine des centromères à la suite de dommages chromatiniens, et à la réponse cellulaire qui en résulte. Notre protéine favorite est une E3 ubiquitine ligase virale nucléaire appelée ICP0 qui a la particularité de localiser dans les corps PML et les centromères et de les déstabiliser suite à l’induction de la dégradation par le protéasome de protéines de ces deux domaines. Nous étudions la désorganisation des domaines nucléaires par ICP0 dans le contexte de la latence/réactivation virale.
Hybridation in situ fluorescente (FISH) pour détection d’ARNs et d’ADN sur cellules et sur tissus nerveux (souris, lapin, humains) Immuno-FISH sur cellules et tissus (souris, lapin, humains) Techniques de microscopie fluorescente (Confocal, time lapse,…) Etude de la structure de la chromatine (Digestions MNase ; ChIP, RIP) Interaction protéine/ADN Infection de cellules et de souris par HSV-1. Génération de virus HSV-1 recombinants.
M. Labetoulle (Paris, HSV-1 latence).
D. Anguelov (ENS Lyon, chromatine)
H. Masumoto (Japon, centromères)
A. Londoño-Vallejo (Curie, Télomères)
N. Sawtell (USA, HSV-1 latence)
J. Hill (USA, HSV-1 latence)
S. Efstathiou (U.K., HSV-1 latence)
H. Thiel (Allemagne, HSV-1 latence)
Ramakrishna C., Ferraioli A., Callé A., Openshaw H., Lundberg P. S., Lomonte P., and Cantin E.M. Establishment of HSV1 Latency in Immunodeficient Mice Facilitates Efficient In Vivo Reactivation. PLoS Pathogens.2015 Mar 11 ;11(3):e1004730. (IF : 8.1)
Frecha C., Chevalier S., van Uden P., Rubio I., Siouda M., Saidj D., Cohen C., Lomonte P., Accardi R., and Tommasino M. 2014. Expression of the epidermodysplasia verruciformis-associated genes EVER1 and EVER2 is activated by exogenous DNA and inhibited by LMP1 oncoprotein from Epstein-Barr virus. J Virol. 2014 Nov 5. pii : JVI.02936-14. (IF : 4.7)
Cavallero S., Huot N., Francelle L., Lomonte P., Naas T., Labetoulle M. 2014. Biological features of herpes simplex virus type 1 latency in mice according to experimental conditions and type of neurones. Invest Ophthalmol Vis Sci. 14-14673. (IF : 3.6)
Lomonte P. 2014. PML nuclear bodies, centromeres, and the control of herpes simplex virus 1 latency (review in French). Virologie, 18 (3), 170-179. (IF : 0.1)
Catez F., Rousseau A., Labetoulle M., and Lomonte P. 2014. Detection of the genome and transcripts of a persistent DNA virus in neuronal tissues by fluorescent in situ hybridization combined to immuno-staining. Journal of Visualized Experiment, JoVE, (83), e51091.
The Tudor protein survival motor neuron (SMN) is a chromatin-binding protein that interacts with methylated lysine 79 of histone H3. Sabra M., Texier P., El Maalouf J., and Lomonte P. 2013. Journal of Cell Science 126 (Pt 16) pp. 3664-3677.