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« Laboratoire de Biologie Moléculaire des Eucaryotes ».

Kerstin Bystricky PR1 UPS

Membres de l’équipe :

Kerstin Bystricky PR1 UPS

Bernard Mariamé, CR1 CNRS

Sandrine Kappler-Gratias, IR TTT

Adresse :

« Laboratoire de Biologie Moléculaire des Eucaryotes », LBME,

UMR5099 sur le campus de l’uni­ver­sité Paul Sabatier

Université Paul Sabatier

118 Route de Narbonne

31062 TOULOUSE Cedex France

([https://www-lbme.bio­toul.fr/equi­pes...])

Intérêts et objectifs scientifiques :

L’équipe étudie la struc­ture de la chro­ma­tine et le posi­tion­ne­ment des chro­mo­so­mes avec l’objec­tif de défi­nir leur rôle dans la régu­la­tion de pro­ces­sus liés au méta­bo­lisme de l’ADN : trans­crip­tion et répa­ra­tion.

Nous nous inté­res­sons tout par­ti­cu­liè­re­ment aux méca­nis­mes épigénétiques impli­qués dans la modu­la­tion de l’orga­ni­sa­tion nucléaire et le contrôle de l’expres­sion géni­que. En uti­li­sant les cel­lu­les can­cé­reu­ses mam­mai­res comme modelé d’étude, nous ana­ly­sons la rela­tion entre les dif­fé­ren­tes machi­ne­ries de modi­fi­ca­tion de la chro­ma­tine et la régu­la­tion trans­crip­tio­nelle par les récep­teurs nucléai­res dans le contrôle de la pro­li­fé­ra­tion et la dif­fé­ren­tia­tion cel­lu­laire. Nous déve­lop­pons de nou­veaux outils de visua­li­sa­tion de loci géno­mi­ques sur cel­lu­les vivan­tes et d’ana­lyse d’image afin de déter­mi­ner com­ment l’orga­ni­sa­tion 3D et la dyna­mi­que nucléaire influent sur la régu­la­tion et la coor­di­na­tion des gran­des fonc­tions cel­lu­lai­res. Ces outils per­met­tent d’une part d’étudier les pro­prié­tés bio­phy­si­ques de la chro­ma­tine in vivo et les méca­nis­mes de recom­bi­nai­son diri­gée chez la levure Saccharomyces cere­vi­siae et d’autre part le suivi de l’acti­va­tion trans­crip­tio­nelle dans les cel­lu­les can­cé­reu­ses mam­mai­res.

L’équipe projet ’ANCHOR’ est ins­tallé à l’Institut des Technologies Avancées du Vivant depuis sep­tem­bre 2012 afin de déve­lop­per nos appro­ches de mar­quage de l’ADN sur cel­lu­les vivan­tes vers des appli­ca­tions de cri­blage à haut débit. Un nouvel axe de recher­che sur les méca­nis­mes molé­cu­lai­res de l’infec­tion virale y est mis en œuvre.

Compétences techniques :

La pro­téine LMP1 d’EBV et la muta­gé­nèse de BACs.

The goal of the ANCHOR team is to deve­lop new appli­ca­tions for a live cell DNA bio­sen­sor tech­ni­que based on our recently paten­ted system to inves­ti­gate seve­ral DNA pro­ces­ses. The ANCHOR system is a bipar­tite system com­po­sed of ANCH sequen­ces and OR pro­teins. ANCH DNA sequen­ces are spe­ci­fi­cally and inde­pen­dently reco­gni­zed by OR pro­teins that nucleate and spread from the ANCH sequence over sur­roun­ding DNA. As the OR pro­teins can be fused to a fluo­res­cent repor­ter, increa­sed concen­tra­tion of OR on the ANCH DNA crea­tes a fluo­res­cent focus easily detec­ta­ble by fluo­res­cence micro­scopy. We are applying this tech­no­logy to unco­ver DNA-based mole­cu­lar mecha­nisms in single cells and in high content scree­ning by micro­scopy on living cells to dis­co­ver active mole­cu­les with broad appli­ca­tions, from bio-pro­duc­tion to anti­vi­ral acti­vity.

Collaboration intra et extra association :

Henri Gruffat et Evelyne Manet, INSERM U758, ENS-Lyon.

Dernières publications :