Site de l’association HerPAs

Laboratoire « Integrative Biology of persistent viruses »

Membres de l’équipe :

Wim Burmeister Professeur UJF 04 76 20 72 82 wpb-at-embl.fr

Patrice Morand Professeur UJF (PU-PH) pmo­rand-at-chu-gre­no­ble.fr

Emmanuel Drouet Professeur UJF

Raphaële Germi Maître de confé­ren­ces UJF (MCU-PH)

Sylvie Larrat Maître de confé­ren­ces UJF (MCU-PH)

Nicolas Tarbouriech Maître de confé­ren­ces UJF

Marlyse Buisson Attachée scien­ti­fi­que CHU

Mohammed Habib Chercheur contrac­tuel

Julien Lupo Assistant hos­pi­talo-uni­ver­si­taire UJF

Laurence Grossi Technicien

Charlène Thedevuide Technicien

Julie Dimier Post-Doc

Adresse :

Unit of Virus Host Cell Interactions (UVHCI) UJF-EMBL-CNRS UMI3265

6 rue Jules Horowitz

B.P. 181, F-38042 Grenoble Cedex 9, France

www.uvhci.fr

Intérêts et objectifs scientifiques :

L’acti­vité de notre groupe couvre un grand nombre d’aspects qui vont de la recher­che fon­da­men­tale, essen­tiel­le­ment struc­tu­rale, à la recher­che trans­la­tion­nelle et cli­ni­que concer­nant le virus d’Epstein-Barr (EBV) et le virus de l’hépa­tite C (HCV). Profitant à Grenoble du syn­chro­tron et du site scien­ti­fi­que inter­na­tio­nal dédié à la bio­lo­gie struc­tu­rale, nous étudions la struc­ture des pro­téi­nes vira­les (i) afin d’iden­ti­fier à la fois de nou­vel­les cibles thé­ra­peu­ti­ques et des bio­mar­queurs poten­tiels pour les mala­dies asso­ciés à ses virus, en par­ti­cu­lier les can­cers viro-induits. (ii) mieux com­pren­dre la fonc­tion de ces pro­téi­nes au tra­vers de l’étude de leur struc­ture tri­di­men­sion­nelle et de leur rela­tion avec les pro­téi­nes de la cel­lule hôte. La proxi­mité avec le CHU nous permet également des études ex vivo à partir de pré­lè­ve­ment de mala­des ou de sujets sains pour com­plé­ter les études struc­tu­ra­les. Par exem­ple, nous tra­vaillons actuel­le­ment sur les inte­rac­tions et le rôle de la gly­co­pro­téine BARF1 d’EBV, secré­tée par les cel­lu­les infec­tées avec un rôle immu­no­sup­pres­sif ainsi que sur l’inhi­bi­tion de la pro­téine virale ZEBRA/EB1 et son inte­rac­tion avec la pro­téine cel­lu­laire ubi­nu­cléine. Au niveau struc­tu­ral le groupe s’inté­resse en outre à la machi­ne­rie de répli­ca­tion virale de l’EBV, (exo­nu­cléase, héli­case-pri­mase). Nous tra­vaillons aussi sur la bio­lo­gie struc­tu­rale du virus HCV, notam­ment les com­plexes ARN-pro­téi­nes impli­qués dans la tra­duc­tion, et sur le virus de la vac­cine, un autre virus avec un très grand génome com­posé d’ADN, dont nous étudions, comme pour l’EBV, le com­plexe de répli­ca­tion.

Compétences techniques :

Culture de lignées EBV+ Antivirogramme EBV Production et puri­fi­ca­tion d’anti­corps mono­clo­naux et de Fab Exploration de la méthy­la­tion (bio­lo­gie molé­cu­laire & immu­no­mar­quage) Détection ELISA RT-PCR quan­ti­ta­tive Immunofluorescence Tests fonc­tion­nels immu­ni­tai­res (dosage de cyto­ki­nes, mar­queurs de mem­brane) Production de pro­téi­nes en E. coli, cel­lu­les d’insec­tes, cel­lu­les de mam­mi­fè­res Purification de pro­téi­nes Biologie struc­tu­rale sur pro­téi­nes puri­fiés : Cristallographie, SAXS, ani­so­tro­pie de fluo­res­cence, dichroïsme cir­cu­laire, MALLS (dif­fu­sion sta­ti­que de lumière), DLS (dif­fu­sion dyna­mi­que de lumière) Test enzy­ma­ti­que (lec­teur 96 puits en fluo­res­cence, lumi­nes­cence)

Collaboration intra et extra association :

E. Manet, H. Gruffat (Lyon)

S. Alain (Limoges)

F. Agbalika (Paris)

C. Besson (Paris)

G. Carcelain (Paris)

I. Joab (Paris)

C. Petosa (Grenoble)

J.-L. Lenormand (Grenoble)

E. Wiertz, M. Ressing (Pays-Bas)

J. Middeldorp (Pays-Bas)

S. Savvides (Belgique)