Site de l’association HerPAs

Laboratoire « Chromatin Assembly, Nuclear Domains, Virus »

Research area :

Epigenetic, Chromatin assem­bly/repair, Nuclear bodies, Centromeres, Herpes sim­plex virus 1, latency in neu­rons, trans­crip­tio­nal regu­la­tion. site web

Membres de l’équipe :

Patrick LOMONTE, DR2 CNRS, HDR, patrick.lomonte at univ-lyon1.fr (+3347244379)

Armelle CORPET- MCU/UCBL

Pascale TEXIER, IE2 CNRS

Aleth CALLE IE1 INSERM

Indri ERLIANDRI (Post-doc­to­rant LabEX/UCBL)

Mohamed Ali MAROUI (post-doc ANR-VIRUCEPTION)

Camille Cohen (Doctorante LabEX)

Adresse :

Institut NeuroMyoGène (INMG), _CNRS UMR 5310 - INSERM U1217 - Université Lyon 1

Université Claude Bernard Lyon 1,

16, rue Raphaël Dubois (bât. G. Mendel)

69622 Villeurbanne Cedex

http://www.inmg.fr

Intérêts et objectifs scientifiques :

Les thé­ma­ti­ques déve­lop­pées dans l’équipe sont : (i) d’une part l’étude in vivo, dans un modèle murin, du rôle de l’orga­ni­sa­tion nucléaire impli­quant les domai­nes PML et les cen­tro­mè­res dans le contrôle trans­crip­tion­nel du génome de l’HSV-1 dans les neu­ro­nes des gan­glions tri­ju­maux au cours du pro­ces­sus de latence/réac­ti­va­tion virale ; (ii) d’autre part nous nous inté­res­sons aux modi­fi­ca­tions épigénétiques de la chro­ma­tine des cen­tro­mè­res à la suite de dom­ma­ges chro­ma­ti­niens, et à la réponse cel­lu­laire qui en résulte. Notre pro­téine favo­rite est une E3 ubi­qui­tine ligase virale nucléaire appe­lée ICP0 qui a la par­ti­cu­la­rité de loca­li­ser dans les corps PML et les cen­tro­mè­res et de les dés­ta­bi­li­ser suite à l’induc­tion de la dégra­da­tion par le pro­téa­some de pro­téi­nes de ces deux domai­nes. Nous étudions la désor­ga­ni­sa­tion des domai­nes nucléai­res par ICP0 dans le contexte de la latence/réac­ti­va­tion virale.

Compétences techniques :

Hybridation in situ fluo­res­cente (FISH) pour détec­tion d’ARNs et d’ADN sur cel­lu­les et sur tissus ner­veux (souris, lapin, humains) Immuno-FISH sur cel­lu­les et tissus (souris, lapin, humains) Techniques de micro­sco­pie fluo­res­cente (Confocal, time lapse,…) Etude de la struc­ture de la chro­ma­tine (Digestions MNase ; ChIP, RIP) Interaction pro­téine/ADN Infection de cel­lu­les et de souris par HSV-1. Génération de virus HSV-1 recom­bi­nants.

Collaborations :

M. Labetoulle (Paris, HSV-1 latence).

D. Anguelov (ENS Lyon, chro­ma­tine)

H. Masumoto (Japon, cen­tro­mè­res)

A. Londoño-Vallejo (Curie, Télomères)

N. Sawtell (USA, HSV-1 latence)

J. Hill (USA, HSV-1 latence)

S. Efstathiou (U.K., HSV-1 latence)

H. Thiel (Allemagne, HSV-1 latence)

Dernières publications :

Ramakrishna C., Ferraioli A., Callé A., Openshaw H., Lundberg P. S., Lomonte P., and Cantin E.M. Establishment of HSV1 Latency in Immunodeficient Mice Facilitates Efficient In Vivo Reactivation. PLoS Pathogens.2015 Mar 11 ;11(3):e1004730. (IF : 8.1)

Frecha C., Chevalier S., van Uden P., Rubio I., Siouda M., Saidj D., Cohen C., Lomonte P., Accardi R., and Tommasino M. 2014. Expression of the epi­der­mo­dys­pla­sia ver­ru­ci­for­mis-asso­cia­ted genes EVER1 and EVER2 is acti­va­ted by exo­ge­nous DNA and inhi­bi­ted by LMP1 onco­pro­tein from Epstein-Barr virus. J Virol. 2014 Nov 5. pii : JVI.02936-14. (IF : 4.7)

Cavallero S., Huot N., Francelle L., Lomonte P., Naas T., Labetoulle M. 2014. Biological fea­tu­res of herpes sim­plex virus type 1 latency in mice accor­ding to expe­ri­men­tal condi­tions and type of neu­ro­nes. Invest Ophthalmol Vis Sci. 14-14673. (IF : 3.6)

Lomonte P. 2014. PML nuclear bodies, cen­tro­me­res, and the control of herpes sim­plex virus 1 latency (review in French). Virologie, 18 (3), 170-179. (IF : 0.1)

Catez F., Rousseau A., Labetoulle M., and Lomonte P. 2014. Detection of the genome and trans­cripts of a per­sis­tent DNA virus in neu­ro­nal tis­sues by fluo­res­cent in situ hybri­di­za­tion com­bi­ned to immuno-stai­ning. Journal of Visualized Experiment, JoVE, (83), e51091.

The Tudor pro­tein sur­vi­val motor neuron (SMN) is a chro­ma­tin-bin­ding pro­tein that inte­racts with methy­la­ted lysine 79 of his­tone H3. Sabra M., Texier P., El Maalouf J., and Lomonte P. 2013. Journal of Cell Science 126 (Pt 16) pp. 3664-3677.